经江西省卫生健康委批复，2020年3月26日，江西省胸科医院内镜介入科、介入血管科、外三科（乳腺科）、免疫缺陷科正式开科，其中内镜介入科和介入血管科是江西省内最早拥有独立病房的介入学科之一，同时也是首批国家级介入呼吸病学单修基地，这标志着医院在亚专科发展建设方面日臻成熟。
江西省胸科医院是一家以治疗胸部疾病为主的三级甲等专科医院，在医疗技术飞速发展的时代，医院一直注重学科建设，坚持做强做大品牌专科，建设了包括呼吸内科 、结核科、肺外科、肿瘤科、神经内科、心血管科在内的多个特色医疗学科，并在此基础上不断孵化分支。近几年医院呼吸内科发展为三个病区，结核内科发展为五个病区，肿瘤科发展为两个病区，胸外科发展为三个病区，并于2019年12月成立了中西医结合科和肝病科。
医院一直致力于做精做细亚专科，坚持以发展推动建设，充分利用资源，发挥技术优势，成熟一个发展一个，进一步丰富学科内涵，拓宽诊疗范围。我们将不断突破瓶颈，发挥潜力，着力提升服务人民群众生命安全和身体健康的水平，在求真务实中笃毅前行，在守正创新中实现变道超车。
内镜介入科
江西省胸科院呼吸内镜中心开展气管、支气管诊治工作有30余年的历史，2017年获得全国第一批、全省首家中国医师协会呼吸内镜医师培训基地，是国家卫健委呼吸内镜培训基地和江西省呼吸介入医学领先学科，2019年获得首批国家级介入呼吸病学单修基地。2020年3月26日作为单独科室成立，年介入手术量近万例，其中大多数技术均为省内首次开展，居全国前列。副院长陈中书任中国医师协会内镜医师分会常委和呼吸内镜专委会常委。
科室主要诊疗项目
经支气管镜冷冻治疗术；
经支气管镜微波治疗术；
经支气管镜球囊扩张术；经支气管镜针吸活检术；
经支气管镜支架置入术；
肺大容量肺泡灌洗术；
经支气管镜氩气刀切割电凝术；
全麻硬质气管镜的介入手术；
支气管激光治疗术；
光动力介入治疗术；
支气管导航诊疗术；
介入血管科
介入放射学是一门集医学影像学和临床治疗学于一体的新兴学科，介入诊疗具有安全、微创、高效和并发症少的优势。江西省胸科医院介入血管科是江西省内最早拥有独立病房的介入学科之一，同时也是首批国家级介入呼吸病学单修基地。科室设备齐全，现拥有独立介入手术室、全数字减影血管造影机（DSA）1台、主动脉球囊反搏器1台、心电监护仪1台，独立床位20余张，医生5人，护士 21人，其中高级职称4人，硕士学位 3人，每年手术量约600余台，其中 80 %为三级手术。
科室主要诊疗项目
咯血（肺结核、肺癌、支气管扩张、肺血管畸形、肺动脉假性动脉瘤等）经导管血管栓塞术；
上腔静脉综合征上腔静脉成形及支架植入术；
经皮肺穿刺活检术、经皮肺部肿瘤射频消融术、经皮肺部肿瘤粒子植入术；
良、恶性气道、食道支架植入、取出术等；
科室技术优势
介入血管科致力于开展并提高各种肿瘤综合介入诊疗技术，尤其是针对肺癌、肝癌运用了经皮血管瘤腔内药物灌注术、经导管动脉化疗灌注栓塞术及载药微球等先进介入治疗技术。
内五科（免疫缺陷科）
科室技术力量雄厚，现有医务人员26名，其中主任医师3名、副主任医师1名，主治医生2名，副主任护师1名，主管护师2名。
科室主要诊疗项目
各型结核病（包括肺内肺外结核、结核性胸膜炎、淋巴结结核、重症结核、难治性结核、糖尿病合并结核）;
抗结核药物不良反应;
非结核分枝杆菌病；
肺部真菌病;
免疫缺陷人群相关的结核、真菌、病毒、细菌等感染性疾病；
艾滋病抗病毒治疗及暴露后预防等；
科室技术优势
该科室承担了国家“十一五”、“十二五”艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治科技重大专项的多中心研究——《复治肺结核病化学治疗新方案的研究》、《初治涂阳肺结核含白介素-2治疗研究》、《艾滋病合并结核病治疗策略的研究》、《成人艾滋病适宜治疗策略研究与应用》等。
外三科（乳腺科）
外三科（乳腺科）是在原胸外科的基础上，根据医学精准化发展趋势及医院长远建设的需要应运而生，现秉承诊断精准化、治疗个体化、快速高效康复的理念为广大患者提供安全有效的医疗服务。科室现有副主任医师2人，主治医师2人及住院医师 1人，医学硕士3人。
科室主要诊疗项目
胸部外科疾病的诊断与治疗以及肺、胸壁及纵隔常见病多发病诊断、鉴别诊断及规范化、个体化治疗，如肺癌、纵隔肿瘤、胸壁肿瘤、胸壁结核、肺部先天性疾病、支气管扩张、肺大疱自发性气胸、肺结核、脓胸、外伤性血气胸、胸部外伤、恶性葡萄胎肺转移、绒癌肺转移等胸部疾病的诊断与外科治疗。
乳腺疾病的诊断与治疗，如乳腺癌、乳腺良性肿瘤、乳腺结核、急性乳腺炎及慢性非哺乳期乳腺炎性疾病尤其是肉芽肿性乳腺炎的诊断与特色外科治疗。
骨结核的诊断与治疗，如脊椎结核及四肢骨关节结核的诊断及外科治疗。
颈部及体表包块的诊断与治疗，尤其是颈淋巴结结核以外科治疗为特色的综合治疗。
科室技术优势
外三科（乳腺科）致力于微创腔镜手术（单孔全胸腔镜肺切除术治疗肺部疾病、单孔胸腔镜对交感神经切断术治疗手汗症、微创nuss手术治疗漏斗胸、全腔镜纵隔肿瘤切除术）、乳房保乳手术（乳腺癌保乳手术及多发性溃疡型非哺乳期乳腺炎独特的保留乳房手术）、胸腰椎结核的个体化外科治疗、颈淋巴结结核的外科治疗等技术的研究和开展。
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